中国足协正式成立，黄中成为首任足协主席，主导足球改革，国家队长期集训变为任务需要时短集中，对联赛的框架和发展方向做出了规划，中国足球队水平出现第一次高潮。

第三届：李凤楼（1979-1985）

曾任国足第一任主教练，首次冲击世界杯失败。

第四届：袁伟民（1986-1988）

女排功勋主帅袁伟民出任足协第四届领导，任期内国奥闯进汉城奥运会，中国足球首次“走向世界”。

第五届：年维泗（1988-1992）

有“中国足球教父”之称的新中国第一代国脚、前国足主帅年维泗出任第五届足协领导，中国足协历史上第一位专职的主席。国奥无缘92年巴塞罗那奥运会后离职，未能对当时中国足球现状做出改善。

第六届、第七届：袁伟民（1992-2000）

袁伟民再次出任足协主席，期间还担任中国奥委会主席、副主席、体育总局局长、副局长的职位，但始终兼任足协主席一职，因此任期内，足协真正的话事人为足协专职副主席。

1992-2000年，前足球运动员王俊生成为足协第一位专职副主席，并兼任秘书长，开启中国足球职业化时代，成立甲A联赛，领导制定了中国职业足球发展的纲领性文件《中国足球十年发展规划》。

冲击1998年世界杯和2000年奥运会失败后，2000年4月25日，体育总局调整足协领导班子，阎世铎出任足管中心主任，并在7月取代王俊生正式成为中国足协专职副主席。

阎世铎（2000-2004）

国足首次杀进世界杯，然而在上任半年后决定暂停甲A升降机引发争议。随后，将联赛改造为中超，十年甲A落幕。2005年离任后，任国家体育总局训练局任局长。

任期内中国足球职业联赛的发展遇不进反退，发生了甲B五鼠、龚建平事件等一系列假球、赌球和黑哨丑闻，阎世铎也被指责未能严厉打击“假赌黑”，反而纵容其愈演愈烈。

谢亚龙（2005-2008）

曾任田径中心主任的谢亚龙进入足协工作，任期内中国足球变得一片狼藉，负面新闻众多，中超日渐萧条，国字号球队全线溃败，谢亚龙被送“国字号灾星”称号。谢亚龙还创造了“叉腰肌”的流行语，沦为媒体球迷笑柄，“谢亚龙下课”的口号为流行。

2008年后，谢亚龙被总局安排到行政管理学院学习，2009年被正式免去足协职务。据称，谢亚龙曾向递交了一份“万言书”辞职报告。

2010年，谢亚龙因涉嫌操纵足球比赛收受贿赂犯罪，被依法逮捕。2012年6月，丹东市中级人民法院对其做出的一审判决：判处有期徒刑十年六个月，并处没收个人财产上缴国库。

检方指控谢亚龙涉案金额达172万元，共12项犯罪事实，被足协处以终身禁止参加足球活动。

谢亚龙在狱中获得6表扬，被建议刑期减去一年，已于2019年3月3日刑满释放。

南勇（2009-2010）

南勇1997年就进入足协工作，凭借出色的业务能力在中国足协方面饱受赞誉，被认为管理能力出色，做事公正，是2000年国安退赛事件、武汉退出风波、击破G7联盟、打破央视转播坚冰、获耐克1500万美元赞助、大力发展青少年足球中的关键人物。

但在2010年3月1日，南勇在反赌反黑风暴中落马。因操纵足球比赛涉嫌收受贿赂，南勇被依法逮捕，涉案金额达到200万，案件牵扯数人。2012年6月13日，因犯受贿罪被铁岭市中级人民法院一审判处有期徒刑10年零6个月，并处罚金20万人民币。

韦迪（2010-2013）

2010年1月，在南勇被捕后第七天，原水上中心主任韦迪担任足管中心主任，提出管办分离未得到回应，还曾喊出国足"五年内亚洲一流"的口号，任期内国字号成绩依旧糟糕，2013年辞任。

张剑（2013-2014）

法学硕士，曾任国家体育总局政策法规司司长，存在感较低，任期结束后离开。

蔡振华（2014-2018）

前乒乓球教练、乒羽中心主任蔡振华出任足协主席，张剑任副主席兼秘书长。2010年时，蔡振华就已接替退休的崔大林出任主管足球的总局分管领导。2014年，时任体育总局副局长的蔡振华正式出任中国足协主席，年维泗、王健林担任足协顾问。

任期内，中超迎来“金元时代”，商业价值达到巅峰。并于2016年实现管办分离，足管中心完成摘牌。青训投资力度加强，完善各级青少年联赛，国足15年后重返亚洲世预赛12强赛。

陈戌源（2019-？）

陈戌源曾任上港集团董事长，主导海港集团收购上海东亚，并将俱乐部打造成中超冠军队伍。2019年5月任中国足协换届筹备组组长。2019年8月，出任中国足球协会主席。

期间，国足经历归化球员风波，引发了中超U23政策、中姓名、公益足球等争议，多支球队因难以为继退出足坛，中超“金元时代”落幕。

2023年2月14日，陈戌源因涉严重违法违纪接受中央纪检委审查调查。